Pengelompokkan koleksi buku yang ada di Perpustakaan SMP Negeri 41 Surabaya:

​

1. 000 – Karya Umum

2. 100 – Filsafat

3. 200 – Agama

4. 300 – Ilmu Sosial

5. 400 – Bahasa

6. 500 – Ilmu Murni

7. 600 – Ilmu Terapan

8. 700 – Kesenian, Hiburan & Olahraga

9. 800 – Kesusastraan

10. 900 – Sejarah dan Geografi

​